文件名称：NetworkInference.jl:从数据推断无向网络的方法
文件大小：29KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-06 14:48:27
Julia
网络推断 描述 NetworkInference是一个用于推断（非定向）网络的程序包，其中为每个节点提供了一组测量值。 主要输出是InferredNetwork类型，它表示完全连接的加权网络，其中边缘的权重表示真实网络中存在的边缘的相对置信度。 另请参阅。 注意事项： 该软件包最初是为使用基因表达数据来推断生物网络而编写的，因此使用“网络”而不是“图形”。 但是，这些方法可以应用于其他类型的数据。 当前实现了四种网络推理算法（MI，CLR，PUC和PIDC，在），但我们计划包括更多的算法。 假定网络是无向的，因为到目前为止所包括的所有算法都推断出无向的网络。 因此： 在Edge类型中，节点的顺序是任意的 将网络写入文件时，会在两个方向上写入边，因为下游分析有时需要这样做 InferredNetwork类型包含边的列表，每对基因都有一个边，其中基因的顺序是任意的 安装 Pkg.ad
【文件预览】：
NetworkInference.jl-master
----.travis.yml(822B)
----Project.toml(643B)
----test()
--------data()
--------empirical_bayes_glue_tests.jl(3KB)
--------runtests.jl(4KB)
----appveyor.yml(1KB)
----src()
--------common.jl(2KB)
--------empirical_bayes_glue.jl(6KB)
--------NetworkInference.jl(780B)
--------infer_network.jl(6KB)
--------network_inference.jl(9KB)
----codecov.yml(71B)
----LICENSE.md(1KB)
----.gitignore(44B)
----README.md(6KB)