文件名称:gcvit:基于CViT的工具,用于可视化VCF文件
文件大小:1.22MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-26 03:49:34
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威望 目录 关于 GCViT是用于重测序或SNP阵列数据的全基因组可视化的工具,它可以读取GFF和VCF格式的数据,并允许用户比较两个或多个登录,以目视确定整个参考基因组的相似性和差异性区域。 可以通过身份验证来控制对数据集的访问。 GCViT建立在CViTjs之上, CViTjs是一个Javascript应用程序,用于查看全基因组规模的基因组特征。 GCViT在Go中实现。 可以使用Docker映像。 GCViT公开了一个API,并且只能作为服务器安装,没有UI。 图1. 6个大豆种质单倍型比较的例子。 在GCViT中探索大豆SNP数据(在SoyBase) 入门 提供了一个示例大豆数据集来测试cvitjs。 首先,建议您使用Docker 。 docker run -d -p 8080:8080 gcvit:latest GCViT现在应该可以从http://localhos