文件名称:CViT-开源
文件大小:536KB
文件格式:GZ
更新时间:2024-05-17 15:25:31
开源软件
CViT-染色体查看工具。 Perl脚本的集合,可快速可视化链接组,伪染色体或细胞遗传图谱上的特征。 旨在用于全基因组数据视图,但可用于创建单个染色体/连锁组,重叠群或BAC甚至蛋白质的图像-在骨架上定位的任何特征。 处理大多数标准的遗传/基因座标系统。 读取GFF3数据并生成PNG或SVG图像。
【文件预览】:
cvit.1.2.1
----config()
--------cvit.ini(17KB)
----pkgs()
--------FontManager.pm(5KB)
--------GFFManager.pm(6KB)
--------CvitLib.pm(3KB)
--------errorlog.pm(4KB)
--------GlyphDrawer.pm(22KB)
--------ConfigManager.pm(49KB)
--------GlyphCalc.pm(35KB)
--------ColorManager.pm(4KB)
--------CvitImage.pm(21KB)
----documentation()
--------settingcolors.txt(2KB)
--------preparedata.txt(6KB)
--------commandline.txt(2KB)
--------drawingoptions.txt(8KB)
----fonts()
--------vera()
--------silkscreen()
----README(4KB)
----icon.png(47KB)
----rgb.txt(12KB)
----examples()
--------Zm-kb()
--------Zm-genetic()
----icon.jpg(8KB)
----cvit.pl(21KB)
----helpers()
--------clusterHSP.pl(3KB)
--------top_blast_hits.awk(206B)
--------splitGFF.pl(2KB)
--------blastp_to_gff.pl(5KB)
----cvit.log(2KB)