文件名称：cpup:将mpileup格式转换为基本计数tsv表
文件大小：378KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-22 11:58:07
bioinformatics mutations samtools snp-genotyping mpileup
cpup 将samtools mpileup结果转换为基本计数tsv 支持多个bam文件 如果不与标签（ -t AD ， -t ADF ， -t ADR ）混淆，则bcftools mpileup可能是一个更好的选择。 samtools mpileup可以按以下格式逐站点汇总映射结果。 第5列（第8列，第11列，第14列...）报告了每个站点中观察到的碱基。 XII 455422 C 16 <<<<<<<<<<<<<<,, FFFFFFFFFFFFFFFF 4 <<,, FFFF XII 455423 T 16 <<<<<<<<<<<<<<,, FFFFFFFFFFFFFFFF 4 <<,, FFFF XII 455424 C 17 <<<<<<<<<<<<<<,,^$, FFFFFFFFFFFFFFFFE 4 <<,, FFFF XII 455425 A 18 <<<<<<<<<
【文件预览】：
cpup-main
----test()
--------sample2.bam(8KB)
--------yeast.bed(36B)
--------sample1.bam(58KB)
--------yeast.fa(1.03MB)
--------yeast.fa.fai(31B)
----cpup.cpp(10KB)
----.gitignore(24B)
----Makefile(270B)
----README.md(2KB)