文件名称:matlab图片叠加的代码-CellShapeClassifier:根据延时视频显微镜的形状对分化过程中的干细胞进行分类
文件大小:6KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-12 13:18:35
系统开源
matlab图片叠加的代码单元格形状分类器 该存储库提供了为以下目的开发的代码: 时移显微镜和基于细胞形状的二维人间充质干细胞分类从成骨和成脂分化中获取成肌能力C. Seiler,A。Gazdhar,M。Reyes,LM Benneker,T。Geiser,KA Siebenrock和B. Gantenbein-Ritter 《组织工程与再生医学杂志》,第8卷,第9期,2014年9月,第737–746页 该代码最初于2012年在MATLAB Central上发布,并于2017年迁移到GitHub。 使用定制的图像处理管道对细胞进行分段。 实施分割流水线是为了将细胞与背景区分开。 分割管道由标准图像处理操作按以下顺序组成: 原始图片 Sobel边缘检测 图像扩张 去除靠近图像边界的对象 图像侵蚀 清除小物件 填补细胞内部的缺口 最终结果在原始图像上的覆盖 从每个分割的细胞中提取了七个形态特征。 因此,我们进行统计分类的特征空间是7维(7D;每个单元格一个矢量),具有以下特征:面积,长轴和短轴长度,周长,偏心率,范围和手指数(Gorelick, PAMI,2006年)。 使用称为节点收获方
【文件预览】:
CellShapeClassifier-master
----classification.m(5KB)
----run_extract_features.m(803B)
----README.md(2KB)
----node_harvesting_classification.R(3KB)
----parseFilenameForLabels.m(489B)
----extractFeatures.m(4KB)