文件名称：varitas:快速合并表格注释源的变体分析
文件大小：338KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-29 03:34:07
Java
VARITAS-快速合并表格注释源的变体注释 VARITAS旨在帮助正在评估基因组序列变异的人们。 设计目标 VARITAS的目标是： 灵活：轻松合并新的数据源，更改文本文件而不是重新编译。 可移植性：如果您更喜欢Linux，但您的老板使用Macintoshes，而实验室中的其他所有人都必须使用Windows，那是IT部门提供的呢？ VARITAS在Java（tm）虚拟机上运行，并且可以作为单个.jar文件安装（但是，它当然需要数据源...） （合理地）小：压缩参考数据集（使用bgzip）以最小化存储空间和磁盘IO。 参考可以存储在您带到实验室会议的笔记本电脑上。 （合理）快速：使用Heng Li的基于tabix R树的间隔索引来索引参考数据集。 为了保持可移植性，在速度方面进行了一些折衷。 汇编 提供了构建包装器。 从github签出代码后，可以在工作目录中运行：./grad
【文件预览】：
varitas-develop
----gradlew(5KB)
----LICENSE.txt(1KB)
----config.js(28B)
----src()
--------main()
----lib()
--------sam-1.78.jar(568KB)
----DataSources.md(4KB)
----ACKNOWLEDGEMENTS.md(2KB)
----gradle()
--------wrapper()
----README.md(9KB)
----gradlew.bat(2KB)
----data()
--------Makefile(5KB)
----.gitignore(109B)
----build.gradle(602B)