文件名称：matlab提取文件要素代码-cell-event-fit:单元事件拟合
文件大小：97KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-10 10:32:27
系统开源
matlab提取文件要素代码单细胞荧光示踪拟合 该存储库提供了使用多起点最大似然拟合将模型函数拟合到单细胞荧光时间迹线的代码。 安装 该程序需要最新版本的Matlab。 它是在R2016b和R2017a中开发和使用的。 但是，其他版本也可以使用。 要安装该程序，请将存储库克隆到Matlab可以访问的位置。 为了确保所有必需的脚本都在Matlab路径上，请运行install_apoptosis_fit函数。 请注意，此存储库中的文件使用UTF-8编码。 如果您的Matlab副本未配置为使用UTF-8，则某些字符可能无法正确显示。 但是，该程序在大多数情况下仍应按预期运行。 用法 该程序可以交互运行或作为功能运行。 交互模式对于少量数据文件很有用，并且无需太多知识即可使用。 但是，交互模式每次运行只允许使用一种模型，并将输出文件保存到默认目录。 作为功能运行程序可提供更灵活的选项。 例如，可以处理散布在多个控制器上的大量文件，可以一次运行多个模型，还可以指定一个自定义目录以输出结果。 数据先决条件 包含要拟合的数据的文件必须是CSV或XLS（X）文件。 在这两种情况下，仅允许数字数据且
【文件预览】：
cell-event-fit-master
----start_apoptosis_fit.m(2KB)
----models()
--------parabola_EARLY_interactive.m(19KB)
--------parabola_EARLY_parameters.m(1KB)
----postprocessing()
--------postproc_LATE_extrapol.m(5KB)
--------postproc_parabola_EARLY.m(3KB)
--------postproc_tmrm_kink.m(8KB)
--------plot_postproc.m(7KB)
--------postproc_kink.m(8KB)
--------postproc_LATE_decay.m(7KB)
--------postproc_mRNA_trivial.m(4KB)
----fit_apoptosis_batch.m(2KB)
----fit_apoptosis_gui.m(20KB)
----preprocessing()
--------preproc_cal520.m(2KB)
--------preproc_psiva.m(2KB)
----LICENSE(18KB)
----.gitignore(71B)
----fit_apoptosis_output.m(2KB)
----fit_apoptosis.m(2KB)
----simulation()
--------negative_parabola_sigmoid_simulate.m(1KB)
--------parabola_sigmoid_simulate.m(2KB)
--------LATE_simulate.m(1KB)
--------mRNA_trivial_model_simulate.m(2KB)
--------LATE_decay_simulate.m(2KB)
--------parabola_EARLY_simulate.m(3KB)
----from_PESTO()
--------setdefault.m(2KB)
--------performOptimization.m(4KB)
--------LICENSE(2KB)
----model_definitions.m(8KB)
----README.md(21KB)
----util()
--------performParallelTask.m(4KB)
--------plotFitResults.m(12KB)
--------logLik.m(3KB)
--------parallel_interactive_task.m(9KB)
--------mssina.m(2KB)
--------do_fitting.m(5KB)
--------reduceData.m(6KB)
--------append_worker_file.m(6KB)
--------parallel_batch_task.m(5KB)
--------append_worker_file_old.m(5KB)
--------get_time.m(955B)
--------scale_t.m(2KB)
--------readInputData.m(18KB)
----material()
--------plot_select.m(3KB)
--------plot_selected.m(3KB)
--------derive_fluorescence.m(2KB)
----install_apoptosis_fit.m(1KB)