iblviewer:具有Jupyter集成的基于Python的多用途可视化工具

时间:2024-04-19 15:20:48
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文件名称:iblviewer:具有Jupyter集成的基于Python的多用途可视化工具

文件大小:1.58MB

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更新时间:2024-04-19 15:20:48

Python

IBL查看器 基于VTK的轻量级快速脑图集可视化工具,该工具使用(GPU)加速了体积和表面渲染。 它可以在python 3.8+上运行,并且正在进行将其完全集成到Jupyter笔记本中的工作。 要求 python3.8 +,numpy,pandas,vtk,pynrrd,matplotlib,ibllib,vedo。 如果安装并使用ibllib,则只需安装vedo。 安装 这是当前(2021年2月)使用pip的安装过程。 稍后将发布一个*,以便您可以“ pip install iblviewer”。 如果您使用像iblenv这样的conda环境,请确保已将其激活。 conda activate iblenv 然后: pip install git+https://github.com/marcomusy/vedo.git pip install git+https://gith


【文件预览】:
iblviewer-main
----preview()
--------viewer_custom_data_sample.jpg(113KB)
--------viewer_atlas_colouring.jpg(85KB)
----.gitignore(2KB)
----README.md(3KB)
----iblviewer.py(961B)
----examples()
--------volume_mapping.ipynb(8KB)
--------insertion_probes.py(3KB)
--------point_neurons.ipynb(5KB)
--------coverage.py(3KB)
--------volume_mapping.py(6KB)
--------data()
--------insertion_probes.ipynb(6KB)
--------point_neurons.py(3KB)
----LICENSE(1KB)
----iblviewer()
--------volume_model.py(6KB)
--------atlas_view.py(14KB)
--------atlas_model.py(17KB)
--------utils.py(19KB)
--------atlas_controller.py(51KB)
--------transfer_function_model.py(5KB)
--------__init__.py(1KB)
--------slicer_model.py(1KB)
--------slicer_view.py(10KB)
--------volume_view.py(12KB)
----setup.py(1KB)
----data()
--------surfaces()

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