svart：用于表示和操纵基因组变异的API

【文件属性】：
文件名称：svart：用于表示和操纵基因组变异的API
文件大小：236KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-17 03:34:38
Java svart-（结构）变体工具 Svart是一个小型数据库，用于表示基因组变异和区域。 它试图解决几个常见问题： 坐标系一一错误 用一致的API表示VCF的小，结构和细分版本 不同的变体修剪策略 该库通过提供默认实现，可扩展的基类和接口以及不变的默认实现，为开发人员创建，处理和比较不同类型的变体提供了一致的API，开发人员可以利用这些默认实现从最少的代码中获得最大的实用性，而不必解决问题在生物信息学中，它们是重复代码和常见错误的常见来源。 该代码完全没有外部依赖项。 动机 它打算用作涉及基因组变异的各种Monarch和与Monarch相关的项目的标准库，例如Jannovar，Exomiser，Squirls，PBGA。 这些项目在某种程度上是相互依赖的，并且都需要某种程度的能力来表示和操纵基因组变异。 考虑到相互依赖性，这些项目的代码库中存在大量围绕基因组变异的核心概念的大量复制/

【文件预览】：
svart-main
----.gitignore(3KB)
----LICENCE(1KB)
----README.md(7KB)
----pom.xml(6KB)
----docs()
--------make.bat(773B)
--------conf.py(5KB)
--------index.rst(970B)
--------explanations.rst(12KB)
--------cookbook.rst(204B)
--------_static()
--------Makefile(602B)
--------motivation.rst(757B)
----src()
--------test()
--------main()