SOS-FERT_SV_analysis:所选小鼠品系中的结构变异分析

时间:2021-04-09 20:28:58
【文件属性】:
文件名称:SOS-FERT_SV_analysis:所选小鼠品系中的结构变异分析
文件大小:1.66MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-04-09 20:28:58
Python SOS-FERT_SV_analysis 6个小鼠系(每行25个样本) 对60个样本(50 + 10个重复序列)进行的初始SV测试运行,基因组覆盖率约为20倍 SV与Manta联合呼吁每条线路 去做: 检查两个高生育力线是否出现相同的SV模式
【文件预览】:
SOS-FERT_SV_analysis-main
----.gitignore(2KB)
----Snakefile1(19KB)
----Snakefile2(9KB)
----scripts()
--------generate_masked_ranges.py(2KB)
--------samtools(4.73MB)
--------filtWhamG.pl(3KB)
--------convertInversion.py(9KB)
----Snakefile3(3KB)
----README.md(268B)
----envs()
--------vep.yml(10KB)
--------survivor.yml(438B)
--------manta.yml(863B)
--------bcftools.yml(1KB)
--------vep101.yml(11KB)
--------smoove.yml(2KB)
--------whamg.yml(356B)

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