TensorSV:基于Tensor的结构变异分析

时间:2024-03-01 17:56:43
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文件名称:TensorSV:基于Tensor的结构变异分析

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更新时间:2024-03-01 17:56:43

Python

基于矩的SV调用和基因分型 版权所有(C)2020-2021 Timothy James Becker T. Becker and D.G. Shin, " TensorSV: structural variation inference using tensors and variable topology neural networks " , 2020 IEEE BIBM, Seoul, Korea (South), 2020, pp. 1356-1360 要求: python 3.6+ cython 0.29+ numpy 1.18+ matplotlib 3.2.1 h5py 2.10 果酱0.15.2 高频0.1.8 tensorflow-gpu 1.15.0(当前仅适用于GPU训练/预测) PIP安装: python3 -m pip install https://


【文件预览】:
TensorSV-master
----setup.py(978B)
----images()
--------tensorsv_logo.png(48KB)
----bin()
--------data_prep.py(79KB)
--------predict_sv.py(49KB)
--------viz()
--------train_sv.py(75KB)
----.travis.yml(429B)
----MANIFEST.in(140B)
----LICENSE(34KB)
----README.md(3KB)
----tensorsv()
--------data()
--------__init__.py(0B)
--------models()

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