【文件属性】:
文件名称:pcgmatlab代码-mri2mrs:结合扩散MRI和MRS
文件大小:6.71MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-28 10:04:46
系统开源
pcg
matlab代码
mri2mrs存储库由Tashrif
Billah和Isaiah
Norton开发。
目录
目录创建者
MRI和MRS的结合
项目流程图
(最右边的列已实现)
引文
如果您在研究中使用我们的软件,请引用以下内容:
比拉,塔什里夫;
以赛亚诺顿;
奥弗·帕斯特纳克(Pasternak)
结合扩散MRI和MRS,,2018,DOI:10.5281
/
zenodo.2576656
安装
您需要Linux工作站来安装和运行mri2mrs命令行模块。
1.依存关系
mri2mrs命令行模块依赖于外部命令,例如unu
,
DWIConvert
,
ants等。要在您的计算机上构建这些命令,请遵循安装1,2,3和5(直到并包括./pnlpipe
std
setup
)。
2.安装环境
接下来,我们需要使外部命令可用于系统路径:
cd
path/to/software/dir
cd
BRAINSTools-bin-*
chmod
+x
env.sh
./env.sh
3.
MATLAB
安装MATLAB(需要许可证)。
提供了在Linux上安装MATLAB的说明。
4.克隆
【文件预览】:
mri2mrs-master
----.gitignore(51B)
----readNrrdHeader.m(7KB)
----LICENSE(10KB)
----mri2mrs.py(7KB)
----tmp-sb.nhdr(404B)
----MRStoAnatomy.m(2KB)
----README.md(6KB)
----sortMat.m(333B)
----getCoordinatefromRDA.m(2KB)
----test_data()
--------Test_SAG_MPRAGE_1mm_isoa.nii(10.88MB)
--------MRS_tha_press_wref.rda(10KB)
--------MRS_tha_press_screenshot.PNG(497KB)
--------MRS_tha_press.rda(10KB)
----pnl-bwh-hms.png(80KB)
----mri2mrs_flowchart.jpg(2.24MB)
----.gitattributes(47B)
----hdr2Nhdr.m(1KB)