文件名称：gpf:GPF
文件大小：3.46MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-10 13:47:31
genomics variants variant-annotation Python
GPF：家庭中的基因型和表型 家庭基因型和表型（GPF）系统管理着从家庭和单个家庭成员的集合中获得的大型遗传变异和表型测量数据库。 该系统的主要应用是管理从Simons Simplex收集的数据，Simons Simplex收集了大约2,600个家庭，其中一个孩子被诊断出患有自闭症。 有关如何使用GPF的信息可以在找到。 发展 我们建议将用作GPF开发环境。 我们使用来强制进行格式设置和类型检查。它包含在下面的conda程序包依赖项中。克隆存储库后，在其中运行以下命令以安装挂钩： pre-commit install 安装GPF依赖项 使用conda-environment.yml文件中的所有conda软件包依赖项创建一个conda gpf环境： conda create \ -c defaults -c conda-forge -c iossifovlab -c bio