文件名称：Ahya-White-Syndromes:用于风信子的 DESeq2、WGCNA 和 PCoA
文件大小：4.45MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-30 13:23:47
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Ahya-White-综合征 ###Differential Gene Expression Analysis via DESeq2 (Love, Huber and Anders 2014) DESeq2 进行基因表达分析需要计数数据文件“25july_diseasecounts.tab”这个文件是每个基因的计数表：行是基因，列是样本样本名称缩写如下：AL = 病灶前，D = 疾病，H = 健康 样本名称后面的数字是个体的基因型：基因型 1-8 被采样两次（疾病和病灶之前的组织被采样），基因型9-16 采样一次（健康菌落）###网络分析通过 WGCNA（Langfelder 和 Horvath，2008） WGCNA 需要方差稳定的基因表达数据，用于最显着差异表达的基因（未调整 pvalue < 0.1）“genes4WGCNA.csv”行是基因，值是方差稳定的数据。 列是具有与上述相同
【文件预览】：
Ahya-White-Syndromes-master
----WGCNA_Ahya.R(12KB)
----PCoA_Ahya.R(2KB)
----VSDandPVALS_disease.csv(21.55MB)
----25july_diseasecounts.tab(4.83MB)
----deseq2_Ahya.R(8KB)
----README.md(1KB)
----genes4WGCNA.csv(2.7MB)
----diseasetraits_reps.csv(1KB)