scipy19:SciPyConf 2019演讲的幻灯片和演示

时间:2024-03-13 04:04:09
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文件名称:scipy19:SciPyConf 2019演讲的幻灯片和演示

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更新时间:2024-03-13 04:04:09

JupyterNotebook

我们Scipy 2019演讲的演示 演讲 幻灯片: 或 演示: :最简单的示例,可用来在Hipylas Lab中检查HiGlass是否正确加载。 :过去约50年使用温度测量的HiGlass python API简介。 :tileset API如何工作以及如何从头构建自己的API的示例。 :使用NYC Taxi数据集演示高级功能。 :显示如何使用和扩展已发布的HiGlass仪表板,以实现协作和可重复性。 入门 要求 Conda v4.6.14 (或更高版本) FUSE: v2.9.7 (或更高版本)或 v3.9.2 (或更高版本) 其他版本也可以使用,但我们仅测试了上述版本。 安装 首先,安装环境: git clone https://github.com/higlass/scipy19 cd scipy19 conda env create -f envir


【文件预览】:
scipy19-master
----point-data.ipynb(10KB)
----basic-setup.ipynb(2KB)
----nyc-taxi.ipynb(24KB)
----genomics.ipynb(4KB)
----utils.py(3KB)
----temperature.ipynb(10KB)
----LICENSE(1KB)
----postBuild(360B)
----environment.yml(227B)
----README.md(3KB)
----data()
--------1573178.csv.gz(1.87MB)
--------nyc-taxi.csv(223B)
--------dots.HFFc6_uC_pooled.all_dots.mapq_30.txt.multires(14.61MB)
--------1577468.csv.gz(629KB)
--------spatial_gene_expression.csv.gz(27MB)
--------nyc-taxi-extended.csv(1KB)
--------1796105.csv.gz(2.81MB)
--------1707246.csv.gz(2.56MB)
--------1577451.csv.gz(510KB)
----slides.pdf(3.32MB)
----.editorconfig(242B)
----apt.txt(26B)
----.gitignore(88B)

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