文件名称:host_gene_microbiome_interactions:整合肠道微生物组和宿主基因表达数据的分析框架
文件大小:32KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-19 05:44:59
R
宿主基因-微生物组相互作用 R中的一个框架,用于识别人类疾病中肠道微生物组组成与宿主基因表达之间的关联。
【文件预览】:
host_gene_microbiome_interactions-main
----lasso()
--------postprocess_lasso_stabsel_output_V2.R(14KB)
--------hdi_lasso_proj_loocv_MSI.R(10KB)
--------identify_case_specific_associations_features.R(3KB)
--------enrichment_lasso_disease_specific_genes.R(12KB)
--------overlap_CRC_IBD_IBS.R(43KB)
--------stabs_stability_selection.R(4KB)
----sparseCCA()
--------msigdb_enrichment_sparseCCA.R(21KB)
--------grid_search_sparseCCA.R(23KB)
--------overlap_enriched_pathways_sparseCCA.R(9KB)
----README.md(163B)