文件名称：cash-program:全面的替代剪接狩猎-开源
文件大小：94.26MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-18 19:49:38
开源软件
CASH（综合替代剪接狩猎）是可视化且用户友好的软件，旨在自构建 AS（替代剪接）位点并检测 RNA-Seq 数据样本之间的差异 AS 事件。 CASH包括两个主要阶段：SpliceCons（Splice site Construction）和SpliceDiff（差分AS检测）。 通过从 RNA-seq 数据全面重建 AS 位点，SpliceCons 显着提高了对 AS 事件的识别，随后，SpliceDiff 使用两种组合统计方法来改进差异 AS 事件的检测。 与我们之前的 ASD 程序不同，我们开发了一个名为 SpliceCons 的新模块，并在 CASH 中实现，并改进了脚本以检测差异 AS 事件。 我们建议使用 CASH，它现在取代了原来的 ASD 版本。 您可以从 sourceforge 或从以下网站下载 CASH。 手册也在下面的网站上。