文件名称：deepvariant：DeepVariant是一个分析管道，使用深度神经网络从下一代DNA测序数据中调用遗传变异
文件大小：31.22MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-25 10:53:46
science machine-learning bioinformatics deep-learning genomics
深变体 DeepVariant是一个基于深度学习的变体调用程序，它接受对齐的读取（BAM或CRAM格式），从中读取堆积图像张量，使用卷积神经网络对每个张量进行分类，最后将结果报告为标准VCF或gVCF文件。 DeepVariant支持二倍体生物中的种系变异调用。 或NGS（Illumina）数据。 PacBio HiFi数据，请参阅。 混合PacBio HiFi + Illumina WGS，请参阅。 牛津纳米Kong使用长期读取数据。 通过使用的GenapSys数据。 另请注意： 对于体型数据或基因型超过两个DNA拷贝的任何其他样品，DeepVariant将无法立即使用，因