文件名称:SbmlInterface.jl:系统生物学标记语言和Julia之间的接口
文件大小:30KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-16 03:52:50
Julia
Sbml接口 SbmlInterface.jl是一个轻量级工具,可以将系统生物学标记语言(SBML)中指定的模型导入到Julia中。 更具体地说,SbmlInterface.jl使用Python libsbml库从SBML文件中提取常微分方程,初始条件和参数值。 尚不支持事件和约束以及其他几个SBML组件。 有几种方法可以在SBML和SbmlInterface中指定相同的模型。 如果在将SBML模型转换为Julia时遇到错误,请通过创建GitHub问题来帮助我们改善SbmlInterface.jl。 安装 SbmlInterface.jl在Julia软件包管理系统上尚不可用。 要安装SbmlInterface,请首先克隆此存储库: user@bash:/$ git clone https://github.com/paulflang/SbmlInterface.jl.git 由于Sbm
【文件预览】:
SbmlInterface.jl-main
----.github()
--------workflows()
----src()
--------SbmlInterface.jl(448B)
--------sbml2modelingtoolkit.jl(8KB)
----Project.toml(471B)
----LICENSE(1KB)
----test()
--------runtests.jl(197B)
--------fixtures()
--------sbml2modelingtoolkit.jl(3KB)
----Manifest.toml(22KB)
----README.md(3KB)
----docs()
--------src()
--------Project.toml(114B)
--------Manifest.toml(23KB)
--------make.jl(523B)
----.gitignore(60B)