SBML.jl:Julia与系统生物学标记语言（SBML）库的接口

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文件名称：SBML.jl:Julia与系统生物学标记语言（SBML）库的接口

文件大小：34KB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-05-03 19:33:09

modeling systems-biology cobra libsbml sbml

SBML.jl 建置状态 文献资料 这是一些libSBML功能的简单包装，主要是用于COBRA分析方法的模型加载。 其他功能将根据需要添加。 随时提交PR，以增加负载的“覆盖率”。 致谢 SBML.jl是在卢森堡大学卢森堡系统生物医学中心（ ）开发的。 这项开发得到了PerMedCoE项目（ ）协议号No.的欧盟Horizo​​n 2020计划的支持。 951773。 安装 ]add SBML # or using Pkg; Pkg . add ( " SBML " ) 用法 using SBML m = readSBML ( " myModel.xml " ) # m is now a Model structure with: m . reactions m . species m . compartments ... 有几个辅助函数，例如，您可以按如下方式获得React，

【文件预览】：
SBML.jl-master
----.github()
--------workflows()
----src()
--------SBML.jl(322B)
--------structs.jl(3KB)
--------version.jl(230B)
--------utils.jl(2KB)
--------readsbml.jl(12KB)
----Project.toml(488B)
----.travis.yml(116B)
----LICENSE(11KB)
----test()
--------runtests.jl(175B)
--------loadmodels.jl(1KB)
--------version.jl(122B)
--------ecoli_flux.jl(2KB)
----Manifest.toml(3KB)
----README.md(1KB)
----docs()
--------src()
--------Project.toml(116B)
--------make.jl(527B)
----.gitignore(819B)