【文件属性】:
文件名称:Bio-Tradis:一套用于分析TraDIS分析结果的工具
文件大小:8.22MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-22 15:41:59
bioinformatics research genomics pathogen sequencing
生物传统
一套用于分析TraDIS分析结果的工具
内容
用法
剧本
分析脚本
内部对象与方法
Perl编程范例
执照
反馈/问题
引文
介绍
Bio :: TraDIS管道提供了用于处理,映射和分析转座子插入测序数据的软件实用程序。 该管道的设计考虑了TraDIS测序协议的数据,但应与各种转座子插入测序协议一起使用,只要它们产生预期格式的数据即可。
有关TraDIS方法的更多信息,请参见http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/32/7/1109和http://genome.cshlp.org/content/19/12/2308 。
安装
Bio-Tradis具有以下依赖性:
所需的依赖项
wa
alt
samtools
Tabix
[R
生物导体
有多种安装Bio-Tradis的方法,下面提供了详细