sqmu:一些用于分析SQM结果的工具

时间:2021-03-06 07:34:02
【文件属性】:
文件名称:sqmu:一些用于分析SQM结果的工具
文件大小:24KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-03-06 07:34:02
Python 该程序是实用程序的集合,用于分析Squeezemeta结果。 安装 将git存储库克隆到您的计算机中: $ git clone 使用提供的yml文件创建并激活conda环境: $ conda env创建-f conda_env.yml $ conda激活sqmu 使用pip安装keggrest软件包: $ pip install keggrest 将符号链接添加到环境的bin文件夹中(或者将项目的bin文件夹添加到$ PATH中) $ cd $ CONDA_PREFIX $ ln -s /path/to/project/sqmu/bin/sqmu.py bin /。
【文件预览】:
sqmu-main
----conda_env.yml(144B)
----sqmu()
--------sqmfiles.pyc(2KB)
--------run.pyc(3KB)
--------network.pyc(6KB)
--------__init__.pyc(246B)
--------graftm.py(3KB)
--------modules_keggmapper.py(1KB)
--------run.py(2KB)
--------__init__.py(77B)
--------modules.py(9KB)
--------modules.pyc(10KB)
--------network.py(6KB)
--------version.pyc(169B)
--------graftm.pyc(3KB)
--------modules_keggmapper.pyc(2KB)
--------version.py(20B)
--------sqmfiles.py(1KB)
----setup.py(766B)
----README.md(559B)
----bin()
--------sqmu.py(9KB)
----test_files()
--------kolist_network.txt(35B)
--------taxlevel_module.txt(99B)
--------kegg_module_list.txt(182B)
--------custom_module_list.txt(308B)

网友评论