deepbrain:用于大脑医学图像的深度学习工具

时间:2024-05-27 00:19:33
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文件名称:deepbrain:用于大脑医学图像的深度学习工具

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更新时间:2024-05-27 00:19:33

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深脑 使用深度学习的大脑图像处理工具专注于速度和准确性。 如何安装 $ pip install deepbrain 可用工具: 提取器 从T1脑MRI(即颅骨剥离)中提取脑组织。 Extractor运行一个定制的U-Net模型,该模型在各种手动验证的颅骨剥离数据集上进行了训练。 为什么选择Extractor不是其他(例如BET FSL,ANT,PINCRAM)? Extractor速度很快。 它的CNN是在Tensorflow上实现的,并经过精心设计以使其尽可能小(即,参数数量更少)。 参见下面的速度比较。 您可以在GPU上实现<2秒的提取。 运行Extractor很容易。 您无需提供任何复杂的参数(例如脑模板或先验概率蒙版),只需使用脑部MRI就足够了。 这是因为该模型是通过涉及大脑MRI各种旋转和方向的数据增强过程进行训练的。 这意味着无论输入脑部MRI的方向如何,提取都将成


【文件预览】:
deepbrain-master
----setup.py(1KB)
----.gitignore(3KB)
----requirements.txt(32B)
----bin()
--------deepbrain-extractor(1KB)
----MANIFEST.in(77B)
----LICENSE(1KB)
----deepbrain()
--------__init__.py(42B)
--------models()
--------segmenter.py(2KB)
--------extractor.py(2KB)
--------train()
----README.md(3KB)
----imgs()
--------extractor.png(440KB)

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