BBMap:(非官方)BBMap短读对齐器和其他生物信息学工具

时间:2024-06-11 06:41:02
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文件名称:BBMap:(非官方)BBMap短读对齐器和其他生物信息学工具

文件大小:6.97MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-11 06:41:02

Java

非官方的BBMap信息库 BBTools的官方资源在这里: 。 BBMap / BBTools (非官方)用于DNA / RNAseq的BBMap短读比对仪,以及其他生物信息学工具。 BBTools生物信息学工具,包括BBMap。 我已经将数十个shell脚本从根目录移到了./sh/ ,以使其整洁。 BBMap / BBTools现在是开源的。 请尝试一下-这是一个3MB的下载文件,并且是用纯Java编写的,因此安装非常简单-只需解压缩并运行即可。 处理除Solid colorspace之外的所有测序平台(Illumina,PacBio,454,Sanger,Nanopore等),为简化代码,我删除了这些颜色。 与bwa,bowtie2,gsnap和smalt相比在各种基因组上的性能(速度,记忆力,敏感性,特异性)的Powerpoint比较: ...但是总而言之,BBMap的速


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