【文件属性】：
文件名称：agi-bio:基因组和蛋白质组学数据探索和模式挖掘
文件大小：581KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-25 16:06:41
genomics genetics artificial-intelligence protein-sequences proteomics
AGI生物
使用OpenCog工具集进行基因组和蛋白质组学研究。 这包括应用MOSES，PLN，模式挖掘和其他OpenCog组件的实验。
存储库利用此软件包，并将基于OpenCog的生物信息学工具的当前开发扩展为服务。
建造和安装
要构建AGI-Bio代码，您将需要首先构建并安装 。 列出的所有前提条件也足以构建此项目。 建筑是“正常”的：
cd to project root dir
mkdir build
cd build
cmake ..
make -j
sudo make install
make -j test
概述
目录布局如下：
-提供GeneNode和MoleculeNode Atom类型。
-用于将外部知识库导入AtomSpace的脚本。
导入MOSES模型的脚本; 这样的模型基于基因表达数据来区分二进制表
【文件预览】：
agi-bio-master
----bioscience()
--------Dockerfile_Eddie(677B)
--------Dockerfile(480B)
--------cython()
--------CMakeLists.txt(632B)
--------types()
--------bioscience.scm(376B)
--------README.md(942B)
--------opencog.conf(6KB)
--------fig.yml(1KB)
----bio-utilities.scm(1KB)
----reduced-atomspaces()
--------reduced-atomspace.scm(2KB)
----reasoning()
--------simple-by-hand()
--------__init__.py(21B)
----CMakeLists.txt(3KB)
----eddie()
--------visualizer-dev()
----relationship-mining()
--------obsolete()
--------reasoner.py(5KB)
----LICENSE(35KB)
----README.md(1KB)
----knowledge-import()
--------SifToScheme.py(2KB)
--------RulesOfTranslation.txt(6KB)
--------obsolete()
--------MSigDB_to_scheme.py(4KB)
--------README.md(1KB)
----.gitignore(70B)
----moses-scripts()
--------export_models_and_fitness.sh(6KB)
--------obsolete()
--------common.sh(523B)
--------README.md(4KB)
--------relate_features_and_genes.sh(2KB)