文件名称:smith-waterman:Smith-Waterman算法的OpenCL实现
文件大小:208KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-11 18:44:43
C
史密斯·沃特曼 Smith-Waterman算法的实现,可在带有openCL的CPU和GPU上运行,以对串行并行执行进行基准测试。 基准测试将生成两个随机字符串并进行比较。 建造 转到src目录,然后运行make来构建程序。 $ cd ./src && make all 跑步 要启动程序并查看所有选项,请运行: $ ./sw -h
【文件预览】:
smith-waterman-master
----src()
--------sw_file.c(686B)
--------simpleCL.h(6KB)
--------matrix.c(713B)
--------sw_file.h(390B)
--------sw_serial.c(4KB)
--------sw_opencl.h(794B)
--------matrix.h(444B)
--------Makefile(518B)
--------kernel.cl(1KB)
--------sw_opencl.c(2KB)
--------sw_serial.h(1KB)
--------main.h(1KB)
--------simpleCL.c(33KB)
--------main.c(3KB)
----README.md(393B)
----ausarbeitung()
--------eq()
--------psys_dna.tex(3KB)
--------psys_dna_text.md(19KB)
--------INSTALL_opencl.md(5KB)
--------img()
--------Makefile(1KB)
--------src_examples()
--------bib()
----.gitignore(239B)