GlobalAlignment:Smith-Waterman算法的全局比对

时间:2024-05-25 02:49:36
【文件属性】:

文件名称:GlobalAlignment:Smith-Waterman算法的全局比对

文件大小:98KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-25 02:49:36

Java

结盟 计算生物学/生物信息学类的程序。 该Java程序将使用Smith-Waterman全局对齐算法来找到任意两个给定字符串的最佳全局对齐方式。 用法 要在编译时运行此程序,请调用Alignment.main。 注意 默认情况下,运行结果将写入实例的本地目录中的logs_(iterations)x(lengths).txt中。 可以更改,但目前已进行了硬编码。 警告 不要在单个实例的多个线程中运行该程序。 静态变量用于保持其功能,并且并行运行它们可能会破坏结果。


【文件预览】:
GlobalAlignment-master
----README.MD(637B)
----logs_1x10.txt(53B)
----logs_100x100.txt(34KB)
----logs_100x1000.txt(309KB)
----src()
--------Alignment()
--------Logger()
----logs_10x100.txt(3KB)
----.gitignore(36B)
----logs_1x100.txt(342B)

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