RNA二级结构预测SVMs模型研究 (2008年)

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更新时间:2024-06-13 12:58:10

工程技术 论文

扩展NSSEL标签,对RNA分子中的stem-loop结构和伪结结构进行标记。将RNA分子序列中的碱基编码输入,经过支持向量机(support vector machines, SVMs)模型计算输出相应的结构标记。该模型经过训练后,待预测的RNA分子序列可得到对应的结构标识序列,这些标识序列可通过特定算法,唯一构建包括伪结在内的二级结构。实验结果表明,该算法在可接受的预测精度范围内具有较低的计算复杂度,克服了传统算法计算时间过长,无法在有限时间内得到有效结果的缺点。


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