文件名称:rnasa:用于RNA序列样品的基因表达分析仪
文件大小:16KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-02 20:46:02
Python
纳萨 用于RNA序列样品的基因表达分析仪 安装 $ pip install -U https://github.com/dceoy/rnasa/archive/main.tar.gz 相关命令: pigz pbzip2 bgzip samtools java fastqc trim_galore STAR rsem-refseq-extract-primary-assembly rsem-prepare-reference rsem-calculate-expression Docker镜像 从提取映像。 $ docker image pull dceoy/rnasa 用法 下载和处理资源数据。 $ rnasa download --genome=GRCh38 --dest-dir=/path/to/ref 运行管道进行基因表达分析。 $ rnasa run
【文件预览】:
rnasa-main
----setup.py(1KB)
----.gitignore(2KB)
----Dockerfile(3KB)
----.dockerignore(10B)
----MANIFEST.in(23B)
----LICENSE(1KB)
----docker-compose.yml(274B)
----.github()
--------workflows()
----README.md(1KB)
----wercker.yml(377B)
----rnasa()
--------__init__.py(47B)
--------cli()
--------static()
--------task()