VIP:变体解释管道

时间:2024-03-02 16:35:57
【文件属性】:

文件名称:VIP:变体解释管道

文件大小:240KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-02 16:35:57

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变体解释管道 用法 usage: pipeline.sh -i -o -i, --input required: Input VCF file (.vcf or .vcf.gz). -o, --output required: Output VCF file (.vcf or .vcf.gz). -r, --reference optional: Reference sequence FASTA file (.fasta or .fasta.gz). -a, --assembly optional: Assembly to be used (e.g. GRCh37). Default: GRCh37 -b, --probands optio


【文件预览】:
vip-master
----pipeline_preprocess.sh(11KB)
----.github()
--------pull_request_template.md(264B)
--------ISSUE_TEMPLATE()
----test()
--------pipeline_test.sh(2KB)
--------data()
--------output()
----plugins()
--------vep()
----LICENSE(8KB)
----pipeline_filter.sh(6KB)
----pipeline_annotate.sh(11KB)
----.gitignore(90B)
----README.md(2KB)
----utils()
--------utils.sh(2KB)
--------header.sh(867B)
----pipeline_report.sh(5KB)
----pipeline_inheritance.sh(4KB)
----pipeline.sh(12KB)

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