文件名称:matlab精度检验代码-netGS:基于网络的基因组选择
文件大小:218KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-10 21:00:51
系统开源
matlab精度检验代码netGS(基于网络的基因组选择) 1.系统要求 1.1硬件要求所有代码仅需要一台具有足够RAM来支持内存操作的标准计算机。 1.2软件要求 1.2.1操作系统(OS)要求所有代码都可以在Linux或Windows OS下运行。 此处的代码已在Ubuntu 14.04 LTS上进行了测试。 1.2.2需要使用R语言和Matlab编程软件来运行所有代码。 此处的代码已在R(版本3.4.4)和Matlab(版本8.5(R2015a))上进行了测试。 2.安装指南 下面提供的所有安装指南仅适用于Linux OS。 对于Windows操作系统,可能会略有不同。 2.1 R语言R语言可以根据以下需求在Linux OS下自动安装: sudo apt-get安装r-base 要安装R,您需要sudo帐户的密码。 在普通台式计算机上安装可能需要几分钟。 成功安装R后,您只需在终端中键入'R'即可在R下打开工作区,然后运行以R语言编写的代码。 netGS依赖于两个R软件包:rrBLUP和R.matlab,可以使用以下命令在R工作区中安装它们: install.packages(r
【文件预览】:
netGS-master
----netGS()
--------3_Biomass.m(3KB)
--------snp.csv(271KB)
--------foldid.csv(7KB)
--------2_rrBLUP.R(2KB)
--------biomass_optN.csv(880B)
--------pop_pca.csv(11KB)
--------4_Correlation.R(1KB)
--------model.xml(896KB)
--------1_FluxDist.m(6KB)
--------2_BayesC_pop.R(3KB)
--------2_rrBLUP_pop.R(2KB)
--------2_BayesC.R(2KB)
--------1_FluxDist_pFBA.m(6KB)
--------biomreaction.csv(94KB)
----netGS_env()
--------biomass_optNlowN.csv(3KB)
--------3_Biomass.m(4KB)
--------snp.csv(271KB)
--------foldid.csv(7KB)
--------4_Correlation.R(1KB)
--------model.xml(896KB)
--------1_FluxDist.m(4KB)
--------biomreaction.csv(94KB)
----README.md(12KB)
----netGS_robust()
--------model.xml(896KB)
--------1_FluxDist.m(4KB)