文件名称：Musket - short read error corrector:用于Illumina测序的并行短读错误校正器-开源
文件大小：109KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-05-20 13:29:26
开源软件
Musket是用于Illumina短读数据的基于多级k-mer的高效校正器。 该校正器采用k-mer光谱方法，并在多阶段工作流程中引入了三种校正技术。 我们在校正质量和从头基因组组装措施方面的性能评估结果表明，Musket始终是性能最高的基于替代错误的校正器之一。 此外，Musket使用主从模型进行多线程处理，与所有其他经过评估的校正器相比，它具有出色的并行可伸缩性，并具有极具竞争力的总体执行时间。
【文件预览】：
musket-1.1
----fastq.cpp(5KB)
----.project(2KB)
----kmer.h(2KB)
----kseq.h(2KB)
----voting.cpp(4KB)
----Debug()
--------objects.mk(231B)
--------sources.mk(526B)
--------subdir.mk(1KB)
--------makefile(1KB)
----kmer.cpp(9KB)
----paracorrect.h(1KB)
----option.h(2KB)
----paracorrect.cpp(17KB)
----sparsehash()
--------type_traits.h(15KB)
--------dense_hash_map(16KB)
--------dense_hash_set(14KB)
--------sparsetable(76KB)
--------sparse_hash_map(15KB)
--------internal()
--------sparse_hash_set(14KB)
--------template_util.h(5KB)
----bloom_filter.cpp(419B)
----google()
--------type_traits.h(2KB)
--------dense_hash_map(2KB)
--------dense_hash_set(2KB)
--------sparsetable(2KB)
--------sparse_hash_map(2KB)
--------sparsehash()
--------sparse_hash_set(2KB)
--------template_util.h(2KB)
----thread.cpp(6KB)
----kmerintpair.cpp(792B)
----main.cpp(28KB)
----.settings()
--------org.eclipse.cdt.ui.prefs(90B)
--------org.eclipse.cdt.codan.core.prefs(6KB)
----voting.h(569B)
----LICENSE(34KB)
----barrier.h(365B)
----Makefile(859B)
----.cproject(15KB)
----hash.cpp(4KB)
----message.cpp(439B)
----kseq.cpp(5KB)
----README(302B)
----hash.h(705B)
----bloom_filter.h(14KB)
----fastq.h(1KB)
----lock.h(481B)
----message.h(1KB)
----kmerintpair.h(918B)
----option.cpp(10KB)
----thread.h(4KB)