文件名称：DecGPU: CUDA-based Error Correction:GPU上的第一个分布式并行并行短读错误校正器-开源
文件大小：85KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-05-20 14:10:38
开源软件
DecGPU（GPU上的分布式错误校正）是用于大规模短读取程序集的并行和分布式错误校正算法。 它使用在GPU集群上运行的CUDA C ++和MPI来实现。
【文件预览】：
DecGPU-1.0.7
----main.cpp(5KB)
----CudaGenericFunction.cu(6KB)
----shuffleSequences_fasta.pl(876B)
----AlshaParams.h(3KB)
----config.log(8KB)
----AlshaKmer.h(1KB)
----AlshaParams.cpp(10KB)
----AlshaThread.h(2KB)
----configure(145KB)
----ChangeLog(82B)
----AlshaTypes.h(1KB)
----AlshaMessage.cpp(6KB)
----AlshaKmerCollection.h(1KB)
----AlshaBloomFilter.h(4KB)
----AlshaUtils.cpp(1KB)
----CudaBloomFilter.cu(10KB)
----Makefile.in(1KB)
----config.status(23KB)
----AlshaFastaFileParser.h(518B)
----AlshaKmerCollection.cpp(2KB)
----CudaErrorCorrection.cu(15KB)
----AlshaDefs.h(2KB)
----AlshaMessageQueue.h(2KB)
----configure.ac(4KB)
----CudaDeviceVariables.cu(2KB)
----AlshaMessage.h(4KB)
----AlshaKmer.cpp(2KB)
----AlshaCountingBloomFilter.h(900B)
----AlshaMessageQueue.cpp(5KB)
----README(6KB)
----AlshaBloomFilter.cpp(10KB)
----AlshaFastaFileParser.cpp(1KB)
----AlshaFastqFileParser.cpp(2KB)
----CudaErrorCorrection.h(2KB)
----AlshaCountingBloomFilter.cpp(8KB)
----AlshaFileParser.h(1KB)
----AlshaThread.cpp(35KB)
----AlshaUtils.h(963B)
----AlshaFastqFileParser.h(522B)
----AlshaFileParser.cpp(3KB)
----Alsha.cpp(48KB)
----shuffleSequences_fastq.pl(479B)
----CudaErrorCorrection.linkinfo(318B)
----Alsha.h(2KB)
----CudaGenericFunction.h(2KB)
----CudaGenericFunction.linkinfo(135B)