文件名称：denovo_solid_pipeline:使用SOLiD测序技术进行小基因组组装的管道-开源
文件大小：27KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-05-20 13:26:15
开源软件
denovo_solid_pipeline（DSP）是使用SOLiD测序数据进行短基因组组装的半自动化管道。 流水线的主要特征是通过动态编程来优化读取校正运行次数和计算资源。 与当前可用的流水线（denovo2）相比，DSP还具有生成更多适用于进一步组装步骤的重叠群的优势，从而增加了检测测序错误和/或多态性位点的机会。
【文件预览】：
denovo_solid_pipeline_1.0.1
----install.sh(8KB)
----velvet()
--------Makefile~(6KB)
----denovoadp()
--------denovoadp.cxx(4KB)
--------Makefile(975B)
--------zutil.h(2KB)
--------util.cxx(921B)
--------util.h(675B)
--------zutil.cxx(15KB)
----LICENSE(11KB)
----denovo_solid_pipeline_v1.0.1(24KB)
----preprocessor()
--------denovo_preprocessor_solid_v2.4.pl(13KB)
----postprocessor()
--------denovo_postprocessor_solid_v1.7.pl(8KB)
----dependencies()
--------subdivide(4KB)
--------optimize_assembly_v1.0(10KB)
----README(7KB)
----SAET()