文件名称:Biscap and cfdr:对齐后snp调用和验证的脚本-开源
文件大小:8.03MB
文件格式:GZ
更新时间:2024-06-16 16:48:09
开源软件
用于使用比对预测错误率(BiSCaP)的二项式概率从比对确定纯合和杂合位置的脚本,以及对该方法和其他比对/ SNP调用方法(cFDR)的准确性进行基准测试的方法
【文件预览】:
Binomial-SNP-caller-v0.11
----.DS_Store(6KB)
----Cumulative_Binomial_Probabilities_for_0.1.tab(3.59MB)
----BiSCaP.pl(30KB)
----Binomial_Probabilities_for_0.01.tab(3.39MB)
----test.pileup(2KB)
----._.DS_Store(82B)
----test.reference.fasta(4KB)
----.git()
--------logs()
--------info()
--------index(1KB)
--------COMMIT_EDITMSG(29B)
--------objects()
--------HEAD(23B)
--------config(307B)
--------refs()
--------branches()
--------hooks()
--------description(73B)
----check_test_VCF.pl(12KB)
----Binomial_Probabilities_for_0.1.tab(3.59MB)
----GBiD.pl(12KB)
----Cumulative_Binomial_Probabilities_for_0.01.tab(3.39MB)
----IRMS.pl(11KB)
----ASCII.pm(4KB)
----README(6KB)
----CFDR.pl(17KB)