文件名称:Summix_manuscript:峰会手稿的数据和脚本
文件大小:213.12MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-24 08:12:29
R
Summix_manuscript 用于Summix手稿分析的R脚本和数据。 ancestry_adjusted_datasets 将gnomAD AF调整为均匀AFR或混合秘鲁样品的示例数据集。 引导程序 block_bootstrap.R :执行外显子组/基因组数据的块自举的功能。 source_call.R :一个示例脚本,该脚本执行带有示例变量的块引导程序功能。 exome_gnomad-ref-bherer_all_v2 将Exome 1000基因组和gnomAD等位基因频率数据合并,用于分析。 基因组_gnomad-ref-bherer_all_v2 将基因组1000个基因组和gnomAD等位基因频率数据合并,用于分析。 模拟 Five_ancestry_sim_example.R :用于模拟的示例脚本,使用参考数据和模拟参数数据来模拟种群的基因型频率,然后使用Sum
【文件预览】:
Summix_manuscript-main
----bootstrap()
--------block_bootstrap.R(14KB)
--------sourced_caller.R(1KB)
----simulations()
--------five_ancestry_sim_example.R(8KB)
--------simulation_parameters_generate.R(4KB)
----summix_data()
--------Summix_exome_data.txt.gz(5.47MB)
--------Summix_genome_data_byCHR()
----LICENSE(1KB)
----README.md(955B)