CNV_SV-visualisation:可视化拷贝数变更和结构变体

时间:2024-06-05 11:08:02
【文件属性】:

文件名称:CNV_SV-visualisation:可视化拷贝数变更和结构变体

文件大小:272KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-05 11:08:02

R

可视化CNV和SV数据 用于可视化副本编号变体(CNV)和(SV)数据的脚本。 目录 SV可视化 脚本: 争论 描述 -床 文件要处理 - 输出 输出图名称(另存为png文件) 注意,如果未指定--output参数,则输出文件将与输入的BEDPE文件具有相同的名称,并在末尾添加_SVbezier并将扩展名更改为.png 。 命令行使用示例: Rscript SVbezierPlot.R --bedpe example_data/structural/example-manta-pass.bedpe --output example_data/structural/SVbezierPlot 这将输出类似曲线的图,表示生成的文件中的结构变体。 CNV可视化 将添加用于CNV数据可视化的脚本,包括B等位基因频率(BAF)和对数R比(LLR)图。


【文件预览】:
CNV_SV-visualisation-master
----SVbezierPlot.Rmd(7KB)
----.gitignore(155B)
----SVbezierPlot_files()
--------figure-html()
----README.md(2KB)
----SVbezierPlot.R(2KB)
----SVbezierPlot.md(12KB)
----example_data()
--------structural()

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