【文件属性】:
文件名称:assembly-stats:从FASTA和FASTQ文件获取程序集统计信息
文件大小:1.14MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-25 13:49:13
bioinformatics research genomics pathogen sequencing
装配状态
从FASTA和FASTQ文件获取程序集统计信息。
内容
安装
如果在安装程序集统计信息时遇到问题,请与本地系统管理员联系。 如果您遇到错误,请记录该错误,或通过向我们发送电子邮件。
运行以下命令以将程序assembly-stats安装到/usr/local/bin/ 。
mkdir build
cd build
cmake ..
make
make test
make install
如果您没有root用户访问权限,则可以通过将调用更改为cmake来安装到您选择的目录。 例如:
cmake -DINSTALL_DIR:PATH=/foo/bar/ ..
这将意味着您在/foo/bar/目录中获得了一个assembly-stats的副本。
用法
从文件列表中获取统计信息:
assembly-stats file.fasta another_file.fastq
从