文件名称：fastq-scan:以 JSON 格式输出 FASTQ 汇总统计信息
文件大小：30KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-18 09:38:11
C++
fastq-scan从 STDIN 读取 FASTQ 并以 JSON 格式输出汇总统计信息（读取长度、每次读取质量、每个碱基质量）。 快速扫描 我想要一种以 JSON 格式输出输入 FASTQ 的简单汇总统计信息的快速方法。 有（可能更好）的替代方案，包括和 ，但它们没有输出我想要的 JSON。 在谷歌搜索后，我偶然发现了映泰的问题： . 在这个问题中，我使用了来自 Pierre Lindenbaum 的 C++ 解决方案的代码作为这个程序的基础。 安装 Bioconda fastq-scan在上。 conda install -c bioconda fastq-scan 从源头 git clone git@github.com:rpetit3/fastq-scan.git cd fastq-scan make 这将使用 g++ 编译程序，我会让你处理把它放在哪里。 我已经在 g
【文件预览】：
fastq-scan-master
----.gitignore(11B)
----Makefile(176B)
----LICENSE(1KB)
----.github()
--------FUNDING.yml(721B)
----README.md(10KB)
----example.fq(16KB)
----fastq-scan.cpp(9KB)
----example-q64.fq(16KB)
----example-q33.fq(16KB)