文件名称：分子动力学模拟计算在通用图形 处理芯片上的实现 (2008年)
文件大小：527KB
文件格式：PDF
更新时间：2024-06-12 23:58:04
自然科学 论文
将在计算生物分子中广泛应用的 CHARMM力场应用于 Windows computer cluster server( WCCS)环境下,并实现了该力场及分子动力学模拟程序的通用显卡( GPU)并行计算。对一些多肽链的动力学模拟结果显示,与 CPU计算相比,GPU计算在计算速度上有巨大的提升。与 64位 Athlon 2. 0G相比,在 NVIDIA Ge-Force 8800 GT显卡上的动力学模拟速度提高了至少10倍,而且这个效率比会随着模拟体系及每块尺寸的增大而增大。模拟体系的增大使得 GPU并行单