文件名称:High-Throughput Tabular Data Processor-开源
文件大小:13MB
文件格式:GZ
更新时间:2024-05-18 11:02:43
开源软件
高吞吐量管状数据处理器(HTDP)是Java应用程序,旨在促进由高吞吐量技术(例如大规模并行测序或微阵列)产生的大型文本文件中的数据探索和还原任务。 该软件针对微阵列和深度并行测序数据进行了优化,但是它可以接受任何以字符分隔的表格数据集。 HTDP还可以导入,处理和转换版本可变调用格式(VCF)文件。 4.0、4.1和4.2(http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf)。 HTDP提供快速过滤功能,并且可以处理由单个或多个输入文件组成的数据。 引用:Madanecki P,BałutM,Buckley PG,Ochocka JR,Bartoszewski R,Crossman DK等。 (2018)高通量表格数据处理器–用于处理大型数据集的独立于平台的图形工具。 PLoS ONE 13(2):e0192858。 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858