文件名称：matlab说话代码-CypherImaging:突触小泡池的确定
文件大小：937KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-11 03:41:43
系统开源
matlab说话代码用户手册：用于分析突触小泡释放的软件包。 这是一捆软件包，用于分析来自不同实验方法的数据，以测量突触小泡池的大小或分数。 T基本上，软件包包括以下一般步骤 加载数据中 图像分割以选择突触作为感兴趣区域（ROI） 原始荧光迹线的计算表示为各个ROI内强度值的平均值 背景扣除 漂白校正 通过计算各个突触的平均值得出的平均值曲线的分析 单个突触的分析 数据存储 1荧光分析实验在使用质子泵抑制剂的情况下进行了分析，在该实验设计中，由于突触小泡呈酸性，因此使它们具有荧光性。 在囊泡释放的情况下，pH值的变化会耗尽荧光信号。 质子泵的抑制阻止了再酸化和荧光信号的恢复。 取决于刺激，荧光信号的衰减是特定囊泡池大小的量度。 注意：在我们的实验室中，我们通常使用CypHer附着和bafilomycin作为ATP泵的抑制剂 1.1 CY_PHER分析：具有多种刺激的实验 1.1.1数据预处理根据Sbalzerini等人的数据分段。 （2005）； 通过检测代表局部最大值的质心的分割，该质心另外超出定义的阈值。 通过对原始图像进行扩张，然后减去扩张和原始图像，即可检测出局外物。 零的位置
【文件预览】：
CypherImaging-master
----CyPher_Normalized()
--------f_bleaching()
--------Cy_Pher_Analysis.m(10KB)
--------README_Instruction to Cy_Pher_Analysis_docx.docx(938KB)
--------functions()
----README.md(12KB)
----functions()
--------export2Excel_cypher.m(1KB)
--------m2Calc.m(212B)
--------removeExtraStarts.m(585B)
--------BackSubst_Gauss.m(1KB)
--------checkForValidity_2vec.m(1KB)
--------getIndivResponders.m(517B)
--------checkForValidity.asv(1KB)
--------statistics.m(697B)
--------indxList.m(1021B)
--------analyseTrace.m(2KB)
--------Minimum_median.m(2KB)
--------norm_min_max.m(297B)
--------createBleachingCurve.m(2KB)
--------Readout.m(1KB)
--------detectStim_indiv.m(3KB)
--------getEdges_indiv.m(2KB)
--------checkForValidity.m(1KB)
--------Maximum_median.m(2KB)
--------LoadImages.m(846B)
--------getEdges.m(3KB)
--------LoadMultipage.m(730B)
--------analyseTrace_forBl_withFixed1StStim.m(2KB)
--------featurePoint_Detection()
--------bleaching()
--------getNearestNeighbor.m(1010B)
--------detectStim.m(4KB)
--------Readout_constBG.m(1KB)
--------analyseTrace_forBl_3rdDer.m(1KB)
--------analyseTrace_forBl.m(2KB)
--------removeExtraStops.m(643B)