文件名称：matlab说话代码-beat-pd:使用HCTSA应对突触BEAT-PD挑战
文件大小：4.94MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-11 04:06:57
系统开源
matlab说话代码悉尼神经物理学BEAT-PD DREAM挑战赛入场券 悉尼大学奥利弗·克利夫（Oliver M.Cliff）和本·富尔彻（Ben D.Fulcher）物理学院 在开始之前 获取工具包和数据 克隆我和的叉子。 下载数据，请参见。 整理数据：将测试文件放置在data / CIS-PD / testing_data和data / REAL-PD / testing_data中 如果仅进行预测，则可以在此处停止，只需将predictAllPhenotypes.m调用到makeSubmissionCSVs.m 。 如果要（重新）学习功能，请参见下文。 运行HCTSA 在运行任何代码之前，请确保正确设置了所有路径。 运行preprocessCIS.m和preprocessREAL.m以遍历所有CSV文件并将其提取到.mat文件中（确保您选中了选项）。 运行initCIS.m和initREAL.m初始化hctsa文件（确保您选中了选项）。 如果使用群集，则群集子文件夹中有一些有用的代码。 另外，您可以将runhctsaLocal.m与catch22代码或完整的hctsa结合使用（
【文件预览】：
beat-pd-master
----initCIS.m(2KB)
----cluster()
--------REAL-PD()
--------CIS-PD()
----preprocessCIS.m(1KB)
----preprocessREAL.m(2KB)
----data()
--------credentials.json(767B)
--------gen3-client(14.56MB)
--------manifest.json(2KB)
----submission()
--------BEAT-PD_SC1_OnOff_Submission_Template.csv(27KB)
--------REAL-PD-smartphone_accelerometer-tremor_predictions.csv(9KB)
--------BEAT-PD_SC3_Tremor_Submission_SydneyNeurophysics.csv(22KB)
--------REAL-PD-smartwatch_gyroscope-dyskinesia_predictions.csv(9KB)
--------REAL-PD-smartwatch_accelerometer-tremor_predictions.csv(9KB)
--------BEAT-PD_SC2_Dyskinesia_Submission_SydneyNeurophysics.csv(18KB)
--------REAL-PD-smartwatch_accelerometer-dyskinesia_predictions.csv(9KB)
--------BEAT-PD_SC1_OnOff_Submission_SydneyNeurophysics.csv(26KB)
--------CIS-PD-dyskinesia_predictions.csv(34KB)
--------CIS-PD-tremor_predictions.csv(34KB)
--------REAL-PD-smartphone_accelerometer-dyskinesia_predictions.csv(9KB)
--------REAL-PD-smartwatch_gyroscope-tremor_predictions.csv(9KB)
--------CIS-PD-on_off_predictions.csv(34KB)
--------REAL-PD-smartwatch_gyroscope-on_off_predictions.csv(9KB)
--------BEAT-PD_SC2_Dyskinesia_Submission_Template.csv(19KB)
--------BEAT-PD_SC3_Tremor_Submission_Template.csv(23KB)
--------REAL-PD-smartphone_accelerometer-on_off_predictions.csv(9KB)
--------REAL-PD-smartwatch_accelerometer-on_off_predictions.csv(9KB)
----makeSubmissionCSVs.m(2KB)
----trainAllClassifiers.m(725B)
----initREAL.m(2KB)
----classifiers()
--------REAL-PD-smartwatch_accelerometer-tremor_classifier.mat(116KB)
--------REAL-PD-smartwatch_accelerometer-on_off_classifier.mat(94KB)
--------REAL-PD-smartwatch_gyroscope-on_off_classifier.mat(94KB)
--------REAL-PD-smartphone_accelerometer-dyskinesia_classifier.mat(101KB)
--------REAL-PD-smartphone_accelerometer-tremor_classifier.mat(116KB)
--------REAL-PD-smartwatch_gyroscope-dyskinesia_classifier.mat(102KB)
--------CIS-PD-tremor_classifier.mat(148KB)
--------REAL-PD-smartwatch_accelerometer-dyskinesia_classifier.mat(102KB)
--------CIS-PD-on_off_classifier.mat(142KB)
--------REAL-PD-smartwatch_gyroscope-tremor_classifier.mat(116KB)
--------REAL-PD-smartphone_accelerometer-on_off_classifier.mat(94KB)
--------CIS-PD-dyskinesia_classifier.mat(155KB)
----predictAllPhenotypes.m(715B)
----predictPhenotype.m(3KB)
----.gitignore(73B)
----README.md(9KB)
----runHCTSALocal.m(2KB)
----trainClassifier.m(4KB)