文件名称:tama:模块化算法的转录组注释(用于长时间读取的RNA测序数据)
文件大小:448KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-23 15:48:02
Python
多摩 模块化算法的转录组注释 该软件设计用于处理Iso-Seq数据和其他长时间读取的转录组数据。 参见Wiki中的手册: : 如果您对如何运行TAMA有任何疑问,请在本回购的Github问题中发布它们,我将尽快答复。 还值得检查已解决的问题,以查看您的问题是否已得到回答。 如果我在问题页面上没有回应,您可以直接通过以下地址给我发送电子邮件(有时我没有收到通知):gmail dot com上的GenomeRIK 要引用TAMA,请在BMC基因组学中使用我们的论文: :
【文件预览】:
tama-master
----tmp.py(251KB)
----images()
--------Wobble_walking.png(4KB)
--------processing_pipeline.png(129KB)
--------Pipeline2.png(35KB)
--------Pipeline1.png(33KB)
--------Collapse1.png(18KB)
--------deg_sig_diagram.png(40KB)
----tama_collapse.py(257KB)
----tama_merge.py(157KB)
----__init__.pyc(195B)
----_config.yml(25B)
----LICENSE(34KB)
----__init__.py(23B)
----test_files()
--------filelist_collapse.txt(132B)
--------test_genome.fa(34KB)
--------filelist_merge.txt(46B)
--------gmap_test.sam(136KB)
----tama_go()
--------README.txt(70B)
--------filter_transcript_models()
--------orf_nmd_predictions()
--------split_files()
--------sequence_cleanup()
--------format_converter()
--------read_support()
--------file_stats()
----README.md(720B)