【文件属性】：
文件名称：D-PPIN:动态蛋白质-蛋白质相互作用网络数据集
文件大小：12.69MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-03-06 04:06:36
Python
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D-PPIN是一个动态网络数据集，由12个不同的酵母细胞动态蛋白质-蛋白质相互作用网络组成。
D-PPIN的统计
在D-PPIN的每个动态网络（例如Krogan_LCMS）中，节点表示编码蛋白质的基因，边缘表示在某个时间戳记下的蛋白质-蛋白质相互作用，并且每个边缘都带有时间戳记（例如node_u，node_v，时间戳记，权重）。
D-PPIN的产生
简而言之，构建动态蛋白质-蛋白质相互作用网络需要两个组件。 第一个是静态蛋白质-蛋白质相互作用网络，第二个是该静态网络中每种蛋白质的时间感知基因表达值序列。 通过主动和共表达的蛋白质分析（如下图所示），构建了一个动态网络。
在此上可以找到用于构建D-PPIN的静态网络。 论文“ Tu BP，Kudlicki A，Rowicka M，McKnight SL。酵母代谢周期的逻辑：细胞过程的时间间隔。科学2005年11月”中的酵母瞬时基因表达
【文件预览】：
D-PPIN-main
----Uetz()
--------Dynamic_PPIN.txt(61KB)
--------Node_Features.txt(334KB)
--------Static_PPIN.txt(20KB)
----Breitkreutz()
--------Dynamic_PPIN.txt(1.07MB)
--------Node_Features.txt(313KB)
--------Static_PPIN.txt(625KB)
----Ito()
--------Dynamic_PPIN.txt(256KB)
--------Node_Features.txt(1.01MB)
--------Static_PPIN.txt(129KB)
----Krogan_MALDI()
--------Dynamic_PPIN.txt(2.28MB)
--------Node_Features.txt(758KB)
--------Static_PPIN.txt(1.35MB)
----main.py(9KB)
----GSE3431.txt(4.29MB)
----Lambert()
--------Dynamic_PPIN.txt(183KB)
--------Node_Features.txt(252KB)
--------Static_PPIN.txt(69KB)
----Gavin()
--------Dynamic_PPIN.txt(4.11MB)
--------Node_Features.txt(914KB)
--------Static_PPIN.txt(2.59MB)
----Ho()
--------Dynamic_PPIN.txt(1.2MB)
--------Node_Features.txt(558KB)
--------Static_PPIN.txt(845KB)
----Hazbun()
--------Dynamic_PPIN.txt(53KB)
--------Node_Features.txt(52KB)
--------Static_PPIN.txt(16KB)
----Tarassov()
--------Dynamic_PPIN.txt(136KB)
--------Node_Features.txt(378KB)
--------Static_PPIN.txt(55KB)
----README.md(2KB)
----Krogan_LCMS()
--------Dynamic_PPIN.txt(2.49MB)
--------Node_Features.txt(798KB)
--------Static_PPIN.txt(1.63MB)
----Yu()
--------Dynamic_PPIN.txt(102KB)
--------Node_Features.txt(421KB)
--------Static_PPIN.txt(36KB)
----Babu()
--------Dynamic_PPIN.txt(3.26MB)
--------Node_Features.txt(1.77MB)
--------Static_PPIN.txt(1.64MB)