GNNs用于蛋白质-蛋白质相互作用

【文件属性】：

文件名称：GNNs用于蛋白质-蛋白质相互作用

文件大小：8.49MB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-03-01 15:28:40

Python

探索图注意力网络架构和图卷积架构以对蛋白质-蛋白质相互作用数据集中的节点进行分类。 在pytorch中实现。 如何运行： 安装requirements.txt中所述的requirements.txt 要运行火车脚本，请使用以下命令： python train.py --model_type=<'GAT' for Graph Attention Network, 'GCN' for Graph Convolution network architecture> --input_dir= --output_dir=<dir to save the model, e.g. 'saved_mo

【文件预览】：
GNNs-for-protein-protein-interaction-master
----core()
--------models.py(2KB)
----requirements.txt(132B)
----data()
--------dataloader.py(2KB)
--------ppi_dataset()
----utils()
--------preprocessing.py(3KB)
----README.md(990B)
----evaluate.py(3KB)
----saved_models()
--------best_model_GAT.pt(528KB)
--------best_model_GCN.pt(175KB)
----train.py(6KB)