文件名称：minian:具有交互式可视化功能的微型镜分析管道
文件大小：542.04MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-30 20:54:26
Python
迷你安 MiniAn是一种分析管道和可视化工具，受和软件包的启发，专门用于数据。 快速入门指南 创建一个新的conda env： conda create --name minian 安装MiniAn：conda conda install -c conda-forge minian 安装管道笔记本： minian-install --notebooks 可选安装演示影片： minian-install --demo 启动jupyter： jupyter notebook并打开笔记本“ pipeline.ipynb” 文献资料 MiniAn文档位于Readthedoc上，网址为： 为MiniAn做贡献 我们希望得到社区的反馈和贡献！ 有关更多详细信息，请参见！ 执照 该项目已获得GNU GPLv3的许可。
【文件预览】：
minian-master
----MANIFEST.in(80B)
----.coveragerc(26B)
----.readthedocs.yaml(283B)
----docs()
--------usermanual.rst(465KB)
--------make.bat(799B)
--------Makefile(795B)
--------source()
----environment.yml(951B)
----demo_data()
--------session1()
--------session2()
----img()
--------workflow.png(660KB)
--------param_temporal_update.png(316KB)
--------param_spatial_update.png(93KB)
--------param_pnr.png(135KB)
----.github()
--------workflows()
----demo_movies()
--------msCam4.avi(68.86MB)
--------msCam1.avi(68.86MB)
--------msCam9.avi(68.86MB)
--------msCam3.avi(68.86MB)
--------msCam10.avi(68.86MB)
--------msCam7.avi(68.86MB)
--------msCam8.avi(68.86MB)
--------msCam5.avi(68.86MB)
--------msCam6.avi(68.86MB)
--------msCam2.avi(68.86MB)
----LICENSE(34KB)
----VERSION(6B)
----requirements.txt(38B)
----requirements()
--------requirements-doc.txt(288B)
--------requirements-base.txt(666B)
----setup.py(1KB)
----.gitignore(2KB)
----README.md(2KB)
----minian()
--------cross_registration.py(18KB)
--------preprocessing.py(5KB)
--------utilities.py(41KB)
--------motion_correction.py(29KB)
--------test()
--------__init__.py(1KB)
--------cnmf.py(68KB)
--------install.py(2KB)
--------visualization.py(77KB)
--------initialization.py(30KB)
----scripts()
--------create-release.sh(2KB)
--------convert_requirements.py(932B)
----pipeline.ipynb(121KB)
----cross-registration.ipynb(13KB)