文件名称：下采样matlab代码-MiniscopeAnalysis:微型镜数据分析包
文件大小：34KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-14 03:03:58
系统开源
下采样matlab代码注意：MiniscopeAnalysis不再开发。 该版本仅与v3 miniscope DAQ软件兼容。 请继续提交有关问题的请求或请求。 我目前正在研究一个称为PIMPN的新分析管道：PIMPN使用Google Colaboratory（虚拟Python环境以及与MiniscopeAnalysis兼容的输入/输出）执行类似的分析。 微型镜分析 微型镜数据分析包由Guillaume Etter（麦吉尔大学西尔文·威廉姆斯实验室）撰写，这是由UCLA的Daniel Aharoni与Golshani实验室，席尔瓦实验室和卡其实验室合作开发的微型镜分析包的更新版本。 它结合了原始ms分析程序包的核心功能，NormCorre对齐和CNMFE源提取。 安装： 下载或克隆此存储库，并将其路径添加到活动Matlab路径列表中 您需要下载或克隆最新版本的CNMFE（）和NormCorre（）并将它们添加到您的路径中。 这很重要，因为MiniscopeAnalysis软件包依赖于这两个工具箱可选：您可以使用CellReg（Ziv实验室，）进行长期细胞注册。 该分析包输出可直接与该代
【文件预览】：
MiniscopeAnalysis-master
----msSelectPropsForTracking.m(2KB)
----msRunCNMFE_large.m(10KB)
----Tools()
--------msCNMFEVideo.m(3KB)
----msGenerateVideoObj.m(4KB)
----msPlayAlignment.m(873B)
----msMeanFrame.m(2KB)
----msPlayVidObj.m(1KB)
----hsvThreshold.m(575B)
----msReadFrame.m(975B)
----msNormCorre.m(3KB)
----msMaxFrames.m(1KB)
----msBatchRun2018.m(4KB)
----msSaveVideo.m(775B)
----msBatchFileList.m(54B)
----LICENSE(34KB)
----README.md(4KB)
----msRun2018.m(3KB)
----msExtractBehavoir.m(4KB)
----msPlotAnalysisSummary.m(3KB)
----msExtractSFPs.m(629B)