genome-bin-tools:用于R中的元基因组可视化和分箱的交互式工具

时间:2024-05-29 19:31:32
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文件名称:genome-bin-tools:用于R中的元基因组可视化和分箱的交互式工具

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更新时间:2024-05-29 19:31:32

metagenomics metagenome-visualization R

gbtools:用于R中的元基因组可视化和分箱的交互式工具 有关详细说明,请参见。 阅读发表在《微生物学前沿》上的 消息 使用gbt_checkinput() (v2.6.0)在R环境中验证输入文件,验证器不再依赖于非核心Perl模块 现在,您可以使用plot功能(v2.5.8)中的markCustomPalette=参数为plot中的分类标记指定自定义颜色。 修复了由SPAdes标头名称不一致引起的Fastg钓鱼脚本中的错误(v2.5.7) 快速开始 这是您可以使用gbtools示例数据在gbtools完成的基本操作(请看此包中的example_data/Olavius_metagenome文件夹)。 以下命令全部在R环境中。 1.安装gbtools 从源包 tar.gz归档文件可以在R_source_package文件夹中找到。 install.packages( " sp "


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