【文件属性】:
文件名称:genome-bin-tools:用于R中的元基因组可视化和分箱的交互式工具
文件大小:20.08MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-10 01:44:52
metagenomics metagenome-visualization R
gbtools:用于R中的元基因组可视化和分箱的交互式工具
有关详细说明,请参见。
阅读发表在《微生物学前沿》上的
消息
使用gbt_checkinput() (v2.6.0)在R环境中验证输入文件,验证器不再依赖于非核心Perl模块
现在,您可以使用plot功能(v2.5.8)中的markCustomPalette=参数为plot中的分类标记指定自定义颜色。
修复了由SPAdes标头名称不一致引起的Fastg钓鱼脚本中的错误(v2.5.7)
快速开始
这是您可以使用gbtools示例数据在gbtools完成的基本操作(请看此包中的example_data/Olavius_metagenome文件夹)。
以下命令全部在R环境中。
1.安装gbtools
从源包
tar.gz归档文件可以在R_source_package文件夹中找到。
install.packages( " sp "