MetagenomeScope:用于(元)基因组装配图的Web可视化工具

时间:2021-05-10 03:20:51
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文件名称:MetagenomeScope:用于(元)基因组装配图的Web可视化工具
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更新时间:2021-05-10 03:20:51
visualization metagenomics genome-assembly JavaScript 元基因组范围 (基于Nijkamp等人,2013年的图2(a)的装配图。) 注意:MetagenomeScope当前正在重构中! MetagenomeScope以前的某些功能目前尚未实现,请尽快进行更改。 感谢您在改进此过程中与我保持联系,如果您有任何疑问,请告诉我。 概括 MetagenomeScope是为宏基因组序列装配图设计的交互式可视化工具。 该工具旨在显示输入图的,同时强调可能与数据中有趣的生物学特征相对应的小规模细节的存在。 为此,MetagenomeScope突出显示图形中重叠群的某些“结构模式”(分层次地重复模式识别),将图形拆分为其连接的组件(默认情况下一次仅显示一个连接的组件),并使用的工具分层布局图的每个连接组件。 MetagenomeScope还包含许多旨在简化装配图的探索性分析的其他功能,包括用于支架可视化,路径修整和通过生物元数据(例如GC内容)对节点着

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